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Text File  |  1996-03-09  |  2KB  |  38 lines
  1.        Document 0333
  2.  DOCN  M9650333
  3.  TI    Ribonuclease H activity during initiation of reverse transcription using
  4.        tRNA(lys)/RNA primer/template of human immunodeficiency virus.
  5.  DT    9605
  6.  AU    Artzi HB; Shemesh J; Zeelon E; Amit B; Kleiman L; Gorecki M; Panet A;
  7.        Bio-Technology General Israel, Ltd., Kiryat Weizmann, Rehovot,; Israel.
  8.  SO    Arch Biochem Biophys. 1996 Jan 15;325(2):209-16. Unique Identifier :
  9.        AIDSLINE MED/96139301
  10.  AB    The specificity of the initial cleavage by the RNaseH activity of HIV-1
  11.        reverse transcriptase (RT) during minus strong-stop DNA synthesis was
  12.        studied using the authentic primer/template tRNA(lys)/HIV RNA. We
  13.        observed that concomitant with the initiation of DNA synthesis, RNaseH
  14.        activity of HIV RT introduced the first endonucleolytic cuts within the
  15.        U5 region of the HIV RNA template, mainly 1 and 3 bases away from the
  16.        primer binding site. To analyze whether the cleavage sites were
  17.        determined by sequence specificity, the authentic U5 region at one of
  18.        the cleavage sites was mutated. The change of sequence did not alter the
  19.        initial cleavage pattern of RNaseH. In order to determine the size of
  20.        the RNA/DNA hybrid that is required for RNaseH activation during reverse
  21.        transcription initiation, DNA synthesis was limited by
  22.        dideoxynucleotides. DNA extension of the tRNA(lys) primer by 17
  23.        deoxyribonucleotides but not by 6 deoxyribonucleotides was sufficient to
  24.        activate the RNaseH site of HIV RT. Taken together, our results indicate
  25.        that during initiation of minus strongstop DNA synthesis by HIV RT, the
  26.        first RNaseH-mediated endonucleolytic cut of the genomic RNA is dictated
  27.        mainly by the length of the nascent DNA and not by sequence preference.
  28.  DE    Base Sequence  Binding Sites  DNA, Viral/BIOSYNTHESIS/GENETICS  Enzyme
  29.        Activation  Human  HIV-1/GENETICS/*METABOLISM  In Vitro  Molecular
  30.        Sequence Data  Ribonuclease H, Calf Thymus/*METABOLISM  RNA/*GENETICS
  31.        RNA-Directed DNA Polymerase/*METABOLISM  RNA, Transfer,
  32.        Lys/GENETICS/*METABOLISM  RNA, Viral/CHEMISTRY/GENETICS/*METABOLISM
  33.        Support, U.S. Gov't, P.H.S.  Transcription, Genetic  JOURNAL ARTICLE
  34.  
  35.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  36.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  37.  
  38.